聚類分析軟件(Version1.2)是一款簡(jiǎn)單實(shí)用的聚類數(shù)據(jù)分析軟件，通過該軟件，用戶可以進(jìn)行相應(yīng)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析，軟件提供了多種數(shù)據(jù)計(jì)算方式，擁有計(jì)算雜合度、計(jì)算多態(tài)性、計(jì)算歐氏距離、進(jìn)行聚類計(jì)算等，您可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的類型進(jìn)行選擇；該軟件主要用于計(jì)算雜合度、多態(tài)信息含量、遺傳距離以及聚類分析，適用于血型、蛋白質(zhì)多態(tài)、品種聚類等方面，按照Nei氏公式(1974)對(duì)各種數(shù)據(jù)進(jìn)行分析計(jì)算，計(jì)算完成后，系統(tǒng)自動(dòng)判斷當(dāng)前所有矩陣中所含的數(shù)據(jù)，并將其導(dǎo)出為Excel文件，方便用戶進(jìn)行保存使用，需要的朋友趕快下載試試吧！

軟件功能

　　定義矩陣：定義數(shù)據(jù)矩陣的大小，用“長(zhǎng)×寬”表示，X軸方向?yàn)槠贩N，Y軸為數(shù)據(jù)；分類數(shù)(位點(diǎn)數(shù))只在用Roger公式計(jì)算遺傳距離時(shí)根據(jù)需要輸入，系統(tǒng)默認(rèn)值為“1”。如輸入“5”ד4”“2”，即表示有5個(gè)品種，4行數(shù)據(jù),2個(gè)基因位點(diǎn)。系統(tǒng)最多支持255個(gè)品種，9999條數(shù)據(jù)。

　　輸入數(shù)據(jù)：按定義的矩陣創(chuàng)建一個(gè)空白矩陣，若沒有定義矩陣大小，則按當(dāng)前矩陣的大小創(chuàng)建空白矩陣。

　　讀入數(shù)據(jù)：將通過“保存矩陣”命令保存到磁盤上的數(shù)據(jù)讀入到系統(tǒng)，系統(tǒng)將自動(dòng)創(chuàng)建一個(gè)大小與之相適應(yīng)的矩陣，并將全部數(shù)據(jù)讀入。

　　追加數(shù)據(jù)：在當(dāng)前矩陣的尾部繼續(xù)添加一個(gè)已保存的數(shù)據(jù)，主要用于計(jì)算遺傳距離。

　　讀入遺傳距離：將保存到磁盤上的遺傳距離數(shù)據(jù)讀入,可直接用于聚類計(jì)算。

　　數(shù)據(jù)正規(guī)化：將當(dāng)前矩陣中的數(shù)據(jù)按“標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化法”進(jìn)行處理。注意：點(diǎn)此命令后，在計(jì)算遺傳距離和進(jìn)行聚類計(jì)算都會(huì)使用經(jīng)過處理后的數(shù)據(jù)。只有在重新讀入或查看原始數(shù)據(jù)后才會(huì)恢復(fù)原始數(shù)據(jù)，再進(jìn)行遺傳距離和聚類計(jì)算就會(huì)按照原始數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算。

　　計(jì)算雜合度：按照Nei氏公式(1974)計(jì)算出各品種的雜合度。

　　計(jì)算多態(tài)性：按照Nei氏公式(1974)計(jì)算出各品種的多態(tài)信息含量。

　　計(jì)算歐氏距離：在將各數(shù)據(jù)讀入到系統(tǒng)后，可用此命令按照Roger公式計(jì)算出各品種之間的遺傳距離。注：如未在“定義矩陣”中定義分類數(shù)(等位基因數(shù))，則系統(tǒng)默認(rèn)其值為1。在此情況下計(jì)算得出的遺傳距離與使用Mahalanobis公式計(jì)算的遺傳距離是一樣的。未注冊(cè)用戶最后3個(gè)品種的遺傳距離不顯示。

　　計(jì)算遺傳距離：在將各數(shù)據(jù)讀入到系統(tǒng)后，可用此命令按照Nei氏公式(1983)計(jì)算出各品種之間的遺傳距離。未注冊(cè)用戶最后3個(gè)品種的遺傳距離不顯示。

　　進(jìn)行聚類計(jì)算：在已計(jì)算或讀入遺傳距離后，可用此命令按P.H.A.Sneath等(1973)的類平均聚類法(UPGMA法，又稱非加權(quán)算術(shù)平均數(shù)成對(duì)聚類法)進(jìn)行系統(tǒng)聚類。聚類結(jié)果說明：第1列No為序列號(hào)，代表是第幾次聚類；第2列D為距離系數(shù)；第3、4列breed1、breed2為參于聚類的兩個(gè)品種，第5列Cluster為聚類后的新名稱，第6列Content為兩品種的名稱。未注冊(cè)用戶最后3次聚類結(jié)果不顯示。

　　查看原始數(shù)據(jù)：將原始數(shù)據(jù)讀入到當(dāng)前矩陣中。并清除正規(guī)化處理過的數(shù)據(jù)。

　　查看遺傳距離：將讀入的遺傳距離或經(jīng)過計(jì)算得到的遺傳距離在當(dāng)前矩陣中顯示。

　　查看聚類圖：按照聚類后的結(jié)果自動(dòng)畫出聚類圖。

　　保存聚類圖：將顯示的聚類圖以圖象文件保存到磁盤上。未注冊(cè)用戶無此功能!

　　保存矩陣：將當(dāng)前矩陣保存到磁盤上。若當(dāng)前矩陣為原始數(shù)據(jù)，則保存原始數(shù)據(jù)；若為經(jīng)過正規(guī)化處理過的數(shù)據(jù)，則保存經(jīng)過處理的數(shù)據(jù)；若為雜合度，則保存雜合度;......;若為聚類結(jié)果，則保存聚類結(jié)果。未注冊(cè)用戶無此功能!

　　數(shù)據(jù)導(dǎo)出：系統(tǒng)自動(dòng)判斷當(dāng)前所有矩陣中所含的數(shù)據(jù)，并將其導(dǎo)出為Excel文件。未注冊(cè)用戶無此功能!

安裝方法

　　1、下載解壓文件，找到JLFX.EXE雙擊安裝

　　2、進(jìn)入安裝界面，點(diǎn)擊下一步進(jìn)行安裝

　　3、選擇安裝目錄D:tools桌面pc0359，用戶也可以自行更改其他安裝位置

　　4、創(chuàng)建菜單文件夾聚類分析，可以幫助用戶快速找到軟件所在位置

　　5、創(chuàng)建桌面快捷方式，可以在桌面快速打開軟件，點(diǎn)擊是即可

　　6、安裝預(yù)覽，可以查看所有安裝信息。點(diǎn)擊上一步可以修改

　　7、正在安裝，請(qǐng)稍后

使用方法

　　1、安裝完成點(diǎn)擊桌面上的軟件打開，界面如圖所示

　　2、點(diǎn)擊矩陣大小，可以在這里控制數(shù)據(jù)的矩陣，定義數(shù)據(jù)矩陣的大小，用“長(zhǎng)×寬”表示，X軸方向?yàn)槠贩N，Y軸為數(shù)據(jù)；分類數(shù)(位點(diǎn)數(shù))只在用Roger公式計(jì)算遺傳距離時(shí)根據(jù)需要輸入，系統(tǒng)默認(rèn)值為“1”。如輸入“5”ד4”“2”，即表示有5個(gè)品種，4行數(shù)據(jù),2個(gè)基因位點(diǎn)。系統(tǒng)最多支持255個(gè)品種，9999條數(shù)據(jù)。

　　3、輸入數(shù)據(jù)，將您的分析數(shù)據(jù)文件導(dǎo)入軟件中進(jìn)行分析，按定義的矩陣創(chuàng)建一個(gè)空白矩陣，若沒有定義矩陣大小，則按當(dāng)前矩陣的大小創(chuàng)建空白矩陣。

　　4、數(shù)據(jù)正規(guī)化，可以將數(shù)據(jù)自動(dòng)排版，將當(dāng)前矩陣中的數(shù)據(jù)按“標(biāo)準(zhǔn)差標(biāo)準(zhǔn)化法”進(jìn)行處理。注意：點(diǎn)此命令后，在計(jì)算遺傳距離和進(jìn)行聚類計(jì)算都會(huì)使用經(jīng)過處理后的數(shù)據(jù)。只有在重新讀入或查看原始數(shù)據(jù)后才會(huì)恢復(fù)原始數(shù)據(jù)，再進(jìn)行遺傳距離和聚類計(jì)算就會(huì)按照原始數(shù)據(jù)進(jìn)行計(jì)算。

　　5、計(jì)算命令，您可以通過鼠標(biāo)點(diǎn)擊不同的計(jì)算項(xiàng)目進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，具有計(jì)算雜合度、計(jì)算多態(tài)性、計(jì)算歐氏距離、進(jìn)行聚類計(jì)算

　　6、數(shù)據(jù)查看及保存命令、查看原始數(shù)據(jù)、查看遺傳距離、保存聚類圖、保存矩陣、數(shù)據(jù)導(dǎo)出

運(yùn)行環(huán)境

　　1、硬件環(huán)境:

　　硬件名稱 最低配置 建議配置

　　1).CPU中央處理器 586 奔騰ＰⅡ以上或兼容芯片

　　2).內(nèi)存 　 32M 64M以上

　　3).硬盤自由空間 1M 10M以上

　　4).顯示器 VGA真彩 SUPER VGA或液晶顯示

　　2、軟件環(huán)境:

　　操作系統(tǒng): Windows95/98/Me/Nt/2000/Xp

　　并安裝有Excel97及以上版本的辦公軟件，否則數(shù)據(jù)無法導(dǎo)出為Excel格式的文件。

　　3、推薦使用：Win2000或Xp操作系統(tǒng)+Office2000。本軟件在win98+win2000上測(cè)試通過，如運(yùn)行不正常，請(qǐng)與作者聯(lián)系。