gene runner軟件 是一款可以幫助生物研究與基因研究的人員提供基因模擬計(jì)算以及圖像數(shù)據(jù)分析的工具，該軟件在數(shù)據(jù)的模擬方面還是可靠的，開(kāi)發(fā)以來(lái)，已經(jīng)受到多位生物基因研究者的推薦，本軟件可以執(zhí)行的命令非常多，支持多種序列分析，您可以在一個(gè)界面上模擬不同組的序列，利用顏色以及圖形的方式區(qū)別基因組的變化過(guò)程，通過(guò)軟件的記錄工具自動(dòng)將實(shí)驗(yàn)得到的數(shù)據(jù)記錄下來(lái)，方便分析實(shí)驗(yàn)的各項(xiàng)數(shù)據(jù)；基因序列分析軟件(Gene Runner)目前還是英文版的，需要的朋友可以下載試試！

軟件功能

　　基因的運(yùn)動(dòng)員是專業(yè)的應(yīng)用旨在提供遺傳學(xué)家和生物學(xué)家提供一個(gè)可靠的工具，可以幫助他們輕松地進(jìn)行基因分析。

　　發(fā)現(xiàn)限制性位點(diǎn)

　　酶限制圖方法位于更多方法菜單中，使您能夠創(chuàng)建限制性映射。

　　在確定限制位點(diǎn)后，可以通過(guò)選擇瓊脂糖凝膠模擬命令來(lái)預(yù)測(cè)瓊脂糖凝膠的限制性片段的電泳分離。在查看模擬凝膠時(shí)，您可以將光標(biāo)移到任何片段上，以顯示其范圍、大小和限制切割每個(gè)末端的限制酶的頭。

　　應(yīng)用程序需要的格式文件所包含的遺傳信息，然后可以使用“ORF分析”（開(kāi)放閱讀框）按鈕，可以讓用戶設(shè)置優(yōu)先核苷酸或氨基酸的大小，以及選擇工作表的翻譯。開(kāi)放的ORF的項(xiàng)目后，用戶可以對(duì)每個(gè)條目進(jìn)行各種注釋。

　　–矩陣模式

　　這種方法，位于更多的方法部分，發(fā)現(xiàn)序列特征，如起始位點(diǎn)，剪接受體位點(diǎn)和剪接供體位點(diǎn)。矩陣模式是在單獨(dú)的數(shù)據(jù)文件中定義，Gene Runner軟件矩陣式文件夾（MAC）。而由密碼子預(yù)測(cè)方法確定的起始密碼子是簡(jiǎn)單框架ATGs，矩陣模式方法考慮局部序列與預(yù)測(cè)功能的子集為ATGS起始密碼子的目的。

　　允許你同步更新兩個(gè)工作在相同的文件在任何或所有五lasergene應(yīng)用在同一時(shí)間。這樣的變化在一個(gè)應(yīng)用程序?qū)⒆詣?dòng)應(yīng)用的兩個(gè)相同的共享數(shù)據(jù)的其他應(yīng)用程序。

　　開(kāi)放和節(jié)省開(kāi)允許你在任何序列文件的命名和保存應(yīng)用以上文件的格式，這是usable市“任何的其他應(yīng)用程序。

　　“限制性分析”功能的基因流道，用戶只需檢查的序列的一部分，通過(guò)進(jìn)入優(yōu)選的切位點(diǎn)。此外，他們可以分析所有的酶的類型或復(fù)發(fā)/非回文。此功能還提供了用戶設(shè)置一個(gè)精確的分析區(qū)域和丟棄出挑的選項(xiàng)。

軟件特色

　　Gene Runner軟件允許你搜索序列或蛋白質(zhì)相匹配的全部或部分的當(dāng)前文件的多個(gè)在線數(shù)據(jù)庫(kù)。另外，你可以搜索軟件的starblast服務(wù)器，與NCBI的BLAST或文本服務(wù)器。執(zhí)行任何應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)搜索菜單Gene Runner軟件在線搜索。

　　你可以開(kāi)始一個(gè)Editseq項(xiàng)目空或空白文檔，或者你可以從各種格式的文件，打開(kāi)一個(gè)現(xiàn)有的序列。如果序列文件長(zhǎng)于需要，可以通過(guò)坐標(biāo)指定序列的子范圍。

　　你也可以從一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)訪問(wèn)Internet或Intranet輸入序列，如DNASTAR的starblast或NCBI的Entrez數(shù)據(jù)庫(kù)。

　　Editseq顯示DNA或蛋白質(zhì)序列和相關(guān)的評(píng)論和特點(diǎn)三可調(diào)的窗格。進(jìn)入一個(gè)新的序列，輸入適當(dāng)?shù)腎ub核苷酸或蛋白質(zhì)編碼。一旦你輸入了一個(gè)序列，你可以選擇將殘基分成三胞胎，十列，或者你選擇的另一組。檢查精度的順序使用Editseq的校對(duì)和語(yǔ)音驗(yàn)證功能。

　　Editseq的搜索功能讓你找到位置，開(kāi)放閱讀框的瞬間。此外，還可以對(duì)序列的任何部分或部分進(jìn)行反轉(zhuǎn)、補(bǔ)充或查看統(tǒng)計(jì)信息。您也可以翻譯DNA序列或反向翻譯蛋白質(zhì)序列使用定制，表達(dá)特定的遺傳密碼。

　　你可以寫(xiě)寫(xiě)序列的任何意見(jiàn)直接進(jìn)入的Editseq窗口中間窗格。默認(rèn)情況下，當(dāng)打開(kāi)序列時(shí)，將在下窗格中顯示。您也可以創(chuàng)建自己的注釋，帶或不帶翻譯，并在一個(gè)共同的標(biāo)題和描述下連接幾個(gè)功能。

安裝方法

　　1、首先下載GeneRunner.msi程序，雙擊安裝，出現(xiàn)歡迎界面，點(diǎn)擊下一步

　　2、設(shè)置軟件的安裝位置C:Program Files (x86)Gene Runner

　　3、安裝預(yù)覽，可以查看所有的安裝信息，這里想要修改的話就點(diǎn)擊上一步

　　4、單擊“下一步”按鈕，系統(tǒng)將對(duì)軟件自動(dòng)進(jìn)行安裝。由于用戶安裝選項(xiàng)不同，所以安裝時(shí)間也不同。直到出現(xiàn)安裝完成則表示系統(tǒng)安裝完畢。

　　5、出現(xiàn)這個(gè)界面就說(shuō)明安裝成功了，在桌面打開(kāi)軟件就能使用了

使用方法

　　選擇一個(gè)或多個(gè)結(jié)果

　　您可以使用以下任何方法選擇結(jié)果窗口中的一個(gè)或多個(gè)結(jié)果。從“BLAST搜索結(jié)果”窗口的頂部窗格或文本搜索結(jié)果窗口中的結(jié)果列表中選擇結(jié)果。一旦選定，則可以打開(kāi)、查看、保存或打印結(jié)果的選擇。

　　·單擊結(jié)果只選擇結(jié)果。

　　檢查每個(gè)結(jié)果，點(diǎn)擊結(jié)果窗口左邊的結(jié)果。使用此方法可選擇一組連續(xù)或非連續(xù)的結(jié)果。這種方法比使用Ctrl +點(diǎn)擊的優(yōu)勢(shì)，因?yàn)槟悴粫?huì)失去選擇的結(jié)果，如果你忘記按住按鈕時(shí)，選擇一個(gè)結(jié)果。

　　文本結(jié)果搜索窗口

　　完成文本搜索后，會(huì)出現(xiàn)文本結(jié)果窗口。

　　文本結(jié)果窗口顯示示例結(jié)果

　　此窗口呈現(xiàn)文本搜索的結(jié)果。在單個(gè)窗格中，列出與搜索條件匹配的所有結(jié)果。您可以搜索文本搜索的結(jié)果，以減少使用搜索文本搜索查詢結(jié)果中描述的技術(shù)的匹配數(shù)，如下。有關(guān)使用“文本搜索查詢結(jié)果”窗口的其他信息，請(qǐng)參見(jiàn)使用搜索結(jié)果窗口。

　　正常開(kāi)放

　　使用此選項(xiàng)，或按Ctrl / Cmd的+ O（贏/ MAC）來(lái)創(chuàng)建一個(gè)新文檔或打開(kāi)一個(gè)現(xiàn)有文件中找到。

　　1。選擇文件>打開(kāi)。

　　2。定位并單擊所需的序列文件。

　　三.如果要分析序列的子范圍，請(qǐng)使用設(shè)置結(jié)束按鈕。

　　4。單擊“打開(kāi)”。

　　復(fù)制

　　使用此選項(xiàng)或按Ctrl + Ctrl + C + +（Win / MAC）復(fù)制到剪貼板中的選擇，同時(shí)仍然保留原始選擇的文件。復(fù)制用當(dāng)前選擇替換剪貼板內(nèi)容。如果范圍選擇器處于活動(dòng)狀態(tài)，并且部分序列已被高亮顯示，則該部分將被復(fù)制到剪貼板作為ASCII文本。表格匯總也復(fù)制為ASCII文本。如果對(duì)象選擇器是活動(dòng)的，或者如果沒(méi)有選擇，整個(gè)測(cè)試表面將被復(fù)制到剪貼板作為Windows圖片。

　　顯示/隱藏可用的方法

　　使用此選項(xiàng)或按Ctrl + + + +（Win / MAC）打開(kāi)的方法在分析的左側(cè)邊緣窗簾。當(dāng)方法幕已打開(kāi)時(shí)，此命令更改為隱藏可用的方法。該方法簾也可以打開(kāi)或關(guān)閉拖動(dòng)“方法窗簾拉”（在測(cè)試文件屏幕左上角的小圓圈）到右邊或左邊。見(jiàn)使用方法窗簾更多信息。

　　位置窗格

　　“功能編輯器”對(duì)話框中的“位置”選項(xiàng)卡打開(kāi)位置窗格。此窗格允許您指定哪些序列坐標(biāo)具有附加的描述性信息，以及如何將該功能標(biāo)記為。該特征可以是一個(gè)連續(xù)的殘基延伸，也可以是一系列段。

使用說(shuō)明

　　偏好

　　僅使用此選項(xiàng)或按CMD +，輸入或更改聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索首選項(xiàng)或默認(rèn)下載文件夾選項(xiàng)。請(qǐng)參見(jiàn)在聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索下設(shè)置首選項(xiàng)，以獲取有關(guān)使用此對(duì)話框的其他信息。

　　分配號(hào)碼Keys tab也可以從這個(gè)對(duì)話框。有關(guān)此選項(xiàng)的附加信息，請(qǐng)參見(jiàn)指定編號(hào)鍵。

　　隱藏Editseq

　　使用此選項(xiàng)隱藏所有打開(kāi)的文檔窗口Editseq。顯示這些窗口，選擇Editseq >顯示全部。

　　退出Editseq

　　使用此選項(xiàng)或按Cmd的+ Q離開(kāi)Editseq。Editseq會(huì)提示你退出前保存未保存的項(xiàng)目。

　　·單擊保存保存文檔。

　　單擊“放棄”關(guān)閉文檔，不保存最近的更改或丟棄從未保存的文檔。

　　單擊“取消”返回文檔，不保存或退出。

　　輸出序列

　　序列可用于其他GeneRunner軟件模塊或外部程序Editseq出口。

　　·選擇文件>保存和另存為一個(gè)序列的文檔保存在GeneRunner軟件格式。

　　·選擇文件>導(dǎo)出保存一個(gè)序列在各種外部文件格式。

　　·選擇文件>導(dǎo)出所有作為一個(gè)拯救所有相同類型的文件打開(kāi)Editseq（DNA或蛋白質(zhì)）在一個(gè)單一文件所需的格式。