COSMOlogic TURBOMOLE 2016
version 7.1 官方版- 軟件大?。?span itemprop="fileSize">1.7 GB
- 更新日期:2017-05-19
- 軟件語言:英文
- 軟件類別:其它行業(yè)
- 軟件授權(quán):免費軟件
- 軟件官網(wǎng):未知
- 適用平臺:WinXP, Win7, Win8, Win10, WinAll
- 軟件廠商:
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Turbomole 2016是一款量子化學(xué)分析軟件,在高級化學(xué)分析中,通過實驗分析數(shù)據(jù)明顯的速度比較慢,得出的結(jié)果也會比較有限的,利用計算機技術(shù)輔助分析就可以幫助您完成多種學(xué)習(xí)元素的分析,您可以在軟件中創(chuàng)建量子化學(xué)模型,結(jié)合實驗得出的數(shù)據(jù),利用其虛擬的實驗技術(shù),可以讓您在COSMOlogic TURBOMOLE 中完成大量復(fù)雜的化學(xué)計算,本軟件具有高效的計算邏輯,無論是有機化學(xué)還是生物化學(xué),都可以在本軟件中完成實驗分析,需要的朋友可以下載試試!
軟件功能
量子化學(xué)
Turbomole是一個功能強大的通用量子化學(xué)程序包為特色的國家的最先進的電子結(jié)構(gòu)方法。它涵蓋了廣泛的學(xué)術(shù)界和工業(yè)界的研究領(lǐng)域。結(jié)合25年多的發(fā)展,已經(jīng)成為一個標(biāo)準(zhǔn)的封裝和Turbomole化學(xué)家的一個有價值的工具,物理學(xué)家和工程師
Turbomole快速和強大的量子化學(xué)
對于世界范圍內(nèi)的研究人員來說,量子化學(xué)計算是必不可少的。在Turbomole我們提供一個強大的、通用的量子化學(xué)(QC)從頭電子結(jié)構(gòu)的計算程序包。
Turbomole可以幫助你優(yōu)化和化學(xué)反應(yīng)提供最佳的催化劑,理解和提高有機發(fā)光二極管(OLED)或預(yù)測光譜作為一種通用的輔助化合物的合成和分析的任務(wù)。它允許準(zhǔn)確預(yù)測的屬性,如構(gòu)象能,簇結(jié)構(gòu),激發(fā)態(tài),過渡態(tài)和偶極子,你可以使用在各種各樣的應(yīng)用。
Turbomole數(shù)據(jù)庫是高質(zhì)量的預(yù)先計算的復(fù)合信息的COSMO-RS計算需要的集合。他們包括在量子化學(xué)水平支持COSMOtherm數(shù)據(jù)庫。每個化合物是由一套宇宙代表(σ表面信息)和能量(氣相能量)文件和物理復(fù)合數(shù)據(jù)的附加文件。只需添加到您的cosmothermx數(shù)據(jù)庫設(shè)置和使用的化合物為你的研究里面的圖形用戶界面
cosmobase
cosmobase是宇宙的旗艦數(shù)據(jù)庫。它幾乎包括了所有常見的溶劑,包括小分子大而復(fù)雜的物質(zhì),與各種官能團覆蓋物質(zhì)類(如烴類,醇類、醚類、羰基化合物、酸、酯、胺、酰胺、硝基化合物、雜環(huán)化合物、鹵代化合物,和更多)。
cosmobaseil
發(fā)現(xiàn)離子液體的世界。
cosmobaseil是一個典型的離子液體的陽離子和陰離子。目前的數(shù)據(jù)庫包含421個陽離子和109個陰離子,可以獨立組合,形成一組巨大的潛在離子液體。
cosmobaseff
作為一種特殊用途的數(shù)據(jù)庫包含超過2000的cosmobaseff香精香料。的cosmobaseff是理想的附加消費品或香水公司。
軟件特色
離子和中性分子:中性和帶電物種的極化電荷密度是在相同的范圍內(nèi),它允許在相同的模型中包含不同電荷態(tài)的化合物。
logki和LSP的線性關(guān)系:LSP構(gòu)成一個最適合的PKI值的線性回歸分析的參數(shù)設(shè)置,根據(jù)研究范式。cosmosar3d提供理論基礎(chǔ),logki值應(yīng)該是LSP的描述符的線性函數(shù)。據(jù)我們所知,目前還沒有其他的分子領(lǐng)域使用MFA可以要求這樣一個健全的理論理由的期望的線性PKI模型。
采用最先進的量子化學(xué)方法如TDDFT,耦合簇,MP2,DFT,Hartree Fock,…
Turbomole已經(jīng)發(fā)展到治療分子的工業(yè)應(yīng)用提供一個快速和穩(wěn)定的代碼。隨著ri-dft的tubromole實施,最快的DFT方法將在您的指尖。
從全平臺靈活性獲利。Turbomole支持Linux,一些Unix系統(tǒng),Windows,和MacOS在串行和并行模式。
安裝方法
1、下載解壓文件,找到TmoleX42_Win64_DEMO.exe,雙擊進入歡迎界面,點擊下一步
2、按照系統(tǒng)提示,單擊“下一步”按鈕,如圖所示。請詳細(xì)閱讀本協(xié)議,認(rèn)可后請點擊“是”按鈕進行下一步操作。
3、如圖所示,系統(tǒng)默認(rèn)的安裝路徑是C:Program FilesCOSMOlogicTmoleX16 ,如果想改變安裝路徑,請使用鼠標(biāo)單擊“瀏覽”按鈕(建議選用默認(rèn)路徑)
4、設(shè)置好所需安裝內(nèi)容后,單擊“下一步”按鈕,彈出設(shè)置程序文件夾操作界面。系統(tǒng)默認(rèn)的程序文件夾是“abcAVI Tag Editor”在一般情況下不需要做任何修改。
5、單擊“下一步”按鈕,系統(tǒng)將對軟件自動進行安裝。由于用戶安裝選項不同,所以安裝時間也不同。直到出現(xiàn)安裝完成則表示系統(tǒng)安裝完畢。
6、出現(xiàn)這個界面就說明安裝成功了,在桌面打開軟件就能使用了
使用方法
cosmosar3d
作為一種替代方法,以相似性為基礎(chǔ)的配體評價,QSAR模型用于關(guān)聯(lián)的分子和它們的生物活性的計算屬性。cosmosar3d是cosmosim3d采用定向配體的LSP作為一種新型的三維定量構(gòu)效關(guān)系分子相互作用場的一個擴展集。
探針分子在網(wǎng)格中隨機旋轉(zhuǎn)和翻譯。對于每個位置,3D相似度計算。與模板和探針分子之間的最大的3D相似性的位置被用于對齊。
從cosmosim3d對齊得到疊加八配體及其宇宙空洞。分子和腔呈現(xiàn)PyMOL。
連續(xù)介質(zhì)模型(CSMS)如PCM或宇宙廣泛應(yīng)用于量子化學(xué)近似的溶劑效應(yīng)。在這里找到一個陣容的影響在溶液和COSMO-RS和CSMS將它們的能力。
基態(tài)化學(xué)
最先進的應(yīng)用在Turbomole允許使用DFT的高效實現(xiàn)化學(xué)的所有領(lǐng)域,MP2和耦合簇方法。自旋軌道耦合效應(yīng)和近年來的發(fā)展,如DFT +分散或明確相關(guān)F12方法可用于高精度的應(yīng)用。
Turbomole和COSMOtherm
生成該文件作為Turbomole COSMOtherm處理溶液熱力學(xué)的輸入。幾個快捷鍵和調(diào)整確保最佳和cosmoconf Turbomole COSMOtherm合作,以最小的努力來獲得最好的結(jié)果。
此外,COSMOtherm是將量子化學(xué)解決方案的理想選擇。通過提供溶劑化的自由能,化學(xué)反應(yīng)可以從量子化學(xué)氣相狀態(tài)轉(zhuǎn)移到所需的流體相。
使用說明
基準(zhǔn)
Turbomole開創(chuàng)了量子化學(xué)方法的發(fā)展準(zhǔn)確模型的可接受的計算成本,實際生活中的應(yīng)用。
一個最重要的模塊并行MPI版本實現(xiàn)了在上世紀(jì)90年代中期在IBM RS6000集群。極其高效的串行代碼并行化獲得有限數(shù)量的一個合理的加速處理器,并擴展到運行在一個大規(guī)模并行系統(tǒng)以后。
一個簡單的使用新的并行SMP和多核系統(tǒng)是最近幾年發(fā)展起來的,這使得低運行時間的典型和廉價的標(biāo)準(zhǔn)個人電腦以及數(shù)以百計的高性能CPU NUMA系統(tǒng)。
周期系統(tǒng)的DFT計算(新模塊:成熟)
成熟是一種基態(tài)能量計算模塊分子和周期性系統(tǒng)在ri-dft水平[ 1 ]
低比例MP2和MP2-F12(新模塊:pnoccsd)
pnoccsd程序包含對自然軌道基礎(chǔ)
大系統(tǒng)縮放。(目前僅限于MP2)[2,3]
CCS兩部分,ADC(2),獨聯(lián)體(INF),和CC2的激發(fā)能量和ADC的興奮狀態(tài)發(fā)生變化的時刻(2)和CC2(RICC2)[ 4 ]
自我定義和幾個預(yù)定義的密度泛函(RIDFT,rdgrad,,aoforce,ESCF)
反應(yīng)路徑優(yōu)化(新模塊:woelfling)優(yōu)化開始與一個線性同步轉(zhuǎn)變(LST)后跟一個鏈的狀態(tài)的方法,優(yōu)化了反應(yīng)路徑的唯一約束下等距的結(jié)構(gòu)。相反,彈性帶或長字符串的方法,它不需要彈簧力,插值算法,或者其他的啟發(fā)式控制結(jié)構(gòu)分布
系統(tǒng)要求
Turbomole優(yōu)化運行的箱體在多種硬件平臺上運行Linux,Windows,蘋果的Mac OS X系統(tǒng),IBM、SGI和Cray Unix / Linux機器,通??稍诔売嬎銠C中心。
在一般情況下,我們建議機器至少有1 GB的內(nèi)存,每個核心和一些十GB的免費磁盤空間。64bit硬件和操作系統(tǒng)是強制性的。所有版本的Turbomole包括并行版本,但強烈要求使用或時間并行作業(yè)Linux是高度推薦。
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COSMOlogic TURBOMOLE 2016 version 7.1 官方版
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