FlowJo是一款十分專業(yè)的流式細胞分析軟件，通過該軟件，用戶可以設(shè)置相關(guān)細胞數(shù)據(jù)，從而分析細胞在各種狀態(tài)下的數(shù)劇變化，有利于在醫(yī)學(xué)上進行各項科學(xué)研究；軟件采用色彩豐富的二維圖進行系統(tǒng)分析，可以讓用戶更直觀的了解細胞的狀態(tài)變化；軟件技術(shù)先進，模擬分析數(shù)據(jù)價值高，擁有流動室和液流驅(qū)動系統(tǒng)，光電轉(zhuǎn)換器和數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)等先進的科學(xué)技術(shù)，能夠滿足研究人員的各項需求，幫助用戶進行更高層次的研究分析；需要的朋友趕快下載試試吧！

流式細胞技術(shù)

　　流式細胞技術(shù)工作原理是在細胞分子水平上通過單克隆抗體對單個細胞或其他生物粒子進行多參數(shù)、快速的定量分析。它可以高速分析上萬個細胞，并能同時從一個細胞中測得多個參數(shù)，具有速度快、精度高、準(zhǔn)確性好的優(yōu)點，是當(dāng)代最先進的細胞定量分析技術(shù)之一。光源、液流通路、信號檢測傳輸和數(shù)據(jù)的分析系統(tǒng)是流式細胞儀的主要組成。目前臨床中運用流式細胞儀進行外周血白細胞、骨髓細胞以及腫瘤細胞等的檢測是臨床檢測的重要組成部分。

軟件功能

　　A.階梯式設(shè)門

　　FlowJo獨特的階梯式設(shè)門試一次革命性的創(chuàng)新。他一改傳統(tǒng)復(fù)雜的邏輯門設(shè)置，將細胞群之間的邏輯關(guān)系用簡單的遞進階梯式去呈現(xiàn)，并可以自定義細胞群名稱、進而直觀的現(xiàn)實細胞群統(tǒng)計值，讓分析結(jié)果一目了然，簡單清晰。

　　B.圖像呈現(xiàn)法

　　B1.多維參數(shù)顯示

　　FlowJo提供了靈活的數(shù)據(jù)呈現(xiàn)方式，全方位滿足用戶的數(shù)據(jù)分析需要。它可以呈現(xiàn)一維的直方圖，傳統(tǒng)的二維圖形，及動態(tài)立體的三維圖形，從多個角度和空間對數(shù)據(jù)進行360°的靜態(tài)以及動態(tài)解析。

　　B2.多種圖形類型

　　FlowJo除了提供傳統(tǒng)的散點圖，還提供多種圖形類型（如密度圖，等高圖，偽色圖，斑馬圖等），在滿足不同分析需求的同時還保證了圖像的美觀和科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)需求。

　　C.多種設(shè)門工具

　　設(shè)門是流失數(shù)據(jù)分析中界定細胞目標(biāo)群的必要手段，不管要檢測的目標(biāo)細胞群是規(guī)則分布還是不規(guī)則分布，小概率事件還是大概率事件，F(xiàn)lowJo提供了多種設(shè)門工具，從而讓用戶方便的界定各種細胞群。

　　D.強大的批量處理功能

　　用戶可以做一個樣品的門分析，然后將這個分析批處理應(yīng)用到其他樣品上；也可以做一個樣品的圖形分析，然后將這個分析批處理用到其他樣品上。這樣避免了對每一個樣品進行重復(fù)性試驗的分析，即保證了數(shù)據(jù)分析的一致性及靈活性，同時也極大地提高了分析的效率并且得到完美的分析結(jié)果。

　　D1.門的批處理

　　你可以將一個樣品的門分析，批量應(yīng)用到其他的樣品上。整個過程只需要輕輕拖動鼠標(biāo)就可完成，非常簡單。

　　D2.圖形分析的批處理

　　圖像處理也可以用批量分析的方法，將一個樣品的分析應(yīng)用到其他樣品上。

　　E.多種分析平臺及工具

　　FlowJo自身包含了多個特殊的分析平臺來滿足細胞周期，細胞增殖，動力學(xué)（鈣離子流量）等的分析。這些平臺采用權(quán)威的已發(fā)表的模型算法原理設(shè)計，來精確模擬數(shù)據(jù)分布。FlowJo還包含了多種獨特的分析工具，如數(shù)據(jù)聯(lián)結(jié)、衍生參數(shù)軸、校準(zhǔn)、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等，讓你對數(shù)據(jù)作進一步的深層分析及處理。

　　F.熒光補償

　　熒光補償是六十分析里面一個重要的概念也是一個復(fù)雜的過程，卻是流式分析必不可缺的部分。軟件補償一改過去在機器上手動調(diào)節(jié)補償?shù)娜唛L復(fù)雜過程，大大簡化了熒光補償過程，將補償數(shù)據(jù)的過程變成一個可理解，可見的簡單過程，同時提供了在機器上手動補償所沒有的精確度和靈活性。

　　G.靈活方便的數(shù)據(jù)導(dǎo)出

　　數(shù)據(jù)的導(dǎo)出在FlowJo里面非常的輕松方便。不管是圖形數(shù)據(jù)還是數(shù)據(jù)表格，都可以方便的導(dǎo)出成各種格式用來做數(shù)據(jù)的分享和發(fā)表。

軟件特色

　　1、省時，批量分析樣本；

　　2、分析和自動控制；

　　3、制作信息電影

　　4、研究分子相互作用，可視化化合物優(yōu)先次序和化合物結(jié)構(gòu)改造

　　5、基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計中，同時考慮多參數(shù)的分子結(jié)構(gòu)

　　6、改造的成功率遠高于只考慮親和性的結(jié)構(gòu)

　　7、能將已有的相關(guān)參數(shù)與實時3D可視化圖形相結(jié)合

安裝方法

　　1、下載解壓文件，找到FlowJo-Win64-10.2.exe雙擊安裝

　　2、選擇安裝位置C:Program FilesFlowJo V10

　　3、創(chuàng)建菜單文件夾

　　4、安裝預(yù)覽

　　5、正在安裝，請稍后

　　6、安裝完成

使用說明

　　FlowJo for Mac推出一些非常復(fù)雜的多變量分析的操作友好的前端，使人們有可能僅僅通過左右拖動圖標(biāo)生成功能強大的批量處理。用它來處理數(shù)百個樣品，并建立完整的表 格和圖形的布局。豐富的多邊形門，出版質(zhì)量的圖表。圖表和表格出口到要執(zhí)行任何后續(xù)處理步驟。填寫演示序號登記表30天的許可證。

常見問題

　　1.散點圖中怎樣調(diào)整坐標(biāo)軸的范圍

　　(備注：只有FCS3.0格式的數(shù)據(jù)可以在散點圖中調(diào)整坐標(biāo)軸的范圍。)

　　點擊坐標(biāo)軸旁邊的“T”按鈕，選擇“Change displayed parameter range”，

　　在彈出的對話框中輸入坐標(biāo)軸范圍的最小值和最大值。

　　2. 直方圖中怎樣調(diào)整Y軸的范圍

　　在圖形窗口中打開“option”選項，在“Y Axis”中選擇“Auto”或者“Manual”，

　　Auto：自動，軟件能自動調(diào)整Y軸的范圍，將整個直方圖顯示出來

　　Manual：手動，需要在后面的“Max”選項中手動輸入Y軸標(biāo)度的最大值，然后按“回車鍵”確認(rèn)。

　　比如，在此例中需要將“Max”值設(shè)為160。

　　3. 反向設(shè)門：怎樣顯示子細胞群在其祖先細胞群中的位置

　　在布局頁中右鍵單擊某個細胞群的圖，在彈出的下拉菜單中選擇“Show Backgating”

　　4. 輸出圖形時怎樣自動對齊

　　在布局頁中選中需要對齊的多個圖形，到布局頁的“排齊”菜單中選擇對齊的類型，常用的有：頂端對齊(Tops)、底部對齊(Bottoms)、左對齊(Lefts)、右對齊(Rights)

　　5. 輸出圖片的格式有哪幾種，哪種的分辨率最高

　　可輸出的圖形格式有6種：PNG, JPG, GIF, SVG, EMF, PDF。其中，SVG為可縮放矢量圖形，EMF格式可以在microsoftoffice里面進行編輯。

　　在做圖形輸出的時候，如果是用作PPT的話，建議在FlowJo里面編輯完畢后再直接將完整的report輸出到PPT，不建議在PPT里面做圖形編輯。如果一定要在PPT做圖形編輯的話，需將圖片保存為EMF格式，這樣可以在PPT2003版本里面做ungroup，進行單個編輯，不過圖片插入PPT后，轉(zhuǎn)變?yōu)镻PT可識別的圖，將會降低分辨率。

　　如果是用作發(fā)表文章的話，建議將圖片保存為PDF格式，再在專業(yè)的圖片編輯器如Photoshop或者Illustrator里面進行編輯，再輸出為雜志要求的文件格式，一般為JPG,現(xiàn)在也有雜志傾向于接收PDF圖片。

　　FlowJo默認(rèn)的圖形輸出格式為PNG格式，如果需要更改，到“編輯”菜單欄里選擇“偏好設(shè)置>文件格式”，在“布局編輯器”的輸出格式類型中選擇：

　　6. 是否可以調(diào)整偽色圖中每個點所表示的細胞個數(shù)，即調(diào)整點的數(shù)目，使其分辨率更高

　　不可以調(diào)整。但是Dot Plot可以調(diào)整。(具體內(nèi)容請參考博文：如何比較不同細胞數(shù)目的流式數(shù)據(jù)?)

　　7. 應(yīng)用模板分析數(shù)據(jù)時，導(dǎo)入數(shù)據(jù)之后，布局編輯器里的圖形批處理結(jié)果顯示為“No Population”

　　在這個例子中，在布局頁中選擇“Exp1”，然后點擊“Batch”按鈕，重新批處理一次，便可得到結(jié)果。

　　8. Mean, Median, Mode, Geom.Mean的區(qū)別

　　Mean：平均熒光強度

　　Median：熒光強度的中位數(shù)

　　Mode：眾數(shù)，是一組數(shù)據(jù)中出現(xiàn)次數(shù)最多的數(shù)值

　　Geometric mean：幾何平均數(shù)，是指n個觀察值連乘積的n次方根，計算公式為：

　　在標(biāo)準(zhǔn)的高斯分布情況下，Median=mean=mode. 通常在流式中因為總會有異常值(超高或者超低值)的存在，不是完美的高斯分布，建議使用Median，降低異常值對數(shù)據(jù)的影響。

　　9. 對于不同樣本，目標(biāo)細胞群所設(shè)的門的范圍及位置不相同，是否影響可比性

　　不影響。同一組實驗中的不同樣本，目標(biāo)細胞群的位置和分布范圍可能會有變化，在設(shè)門的時候，需要將目標(biāo)細胞群都劃在門內(nèi);而在分析數(shù)據(jù)的時候，是以統(tǒng)計學(xué)方法分析整個細胞群的分布情況，得到百分比以及平均熒光強度等數(shù)據(jù)。因此不會影響可比性。