Geneious 10下載
10.2.2 免費(fèi)版- 軟件大小:120 MB
- 更新日期:2017-06-20
- 軟件語言:英文
- 軟件類別:其它行業(yè)
- 軟件授權(quán):免費(fèi)軟件
- 軟件官網(wǎng):未知
- 適用平臺(tái):WinXP, Win7, Win8, Win10, WinAll
- 軟件廠商:
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geneious 10 破解版是一款可以幫助你分析生物基因的軟件,在生物研究中,分析基因序列、氨基酸、蛋白質(zhì)、核酸等數(shù)據(jù)變化大多數(shù)都是利用電腦模擬分析的,通過虛擬的數(shù)據(jù),可以在電腦上創(chuàng)建一個(gè)可以持續(xù)研究的方案,并結(jié)合軟件提供的基因序列組合,實(shí)現(xiàn)最方便的數(shù)據(jù)對比,讓您在計(jì)算序列變化的時(shí)候更加方便;Geneious 10內(nèi)置一個(gè)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),提供多種專業(yè)的數(shù)據(jù)以及文本資源下載,可以直接在軟件界面上選擇您需要研究的數(shù)據(jù)類型,通過下載以后就可以直接顯示在處理界面,對于參考您的生物研究計(jì)劃是非常有幫助的。
軟件功能
分類
NCBI分類學(xué)數(shù)據(jù)庫包含了所有人的名字的有機(jī)體,在NCBI基因數(shù)據(jù)庫表示至少有一個(gè)核苷酸或蛋白質(zhì)序列。
結(jié)構(gòu)
分子模型數(shù)據(jù)庫(MMDB)包含3D分子結(jié)構(gòu),包括蛋白質(zhì)和核酸。內(nèi)存數(shù)據(jù)庫包含超過28000種結(jié)構(gòu)。
SNP
遺傳學(xué)研究的一個(gè)關(guān)鍵方面是將序列變異與遺傳表型聯(lián)系起來。最常見的變異是單核苷酸多態(tài)性(SNP),大約每100到300個(gè)堿基發(fā)生一次。由于單核苷酸多態(tài)性有望促進(jìn)大規(guī)模的關(guān)聯(lián)遺傳學(xué)研究,最近人們對SNP的發(fā)現(xiàn)和檢測產(chǎn)生了濃厚興趣。
PubMed
PubMed是美國國家醫(yī)學(xué)圖書館的一項(xiàng)服務(wù),它包含了超過1600萬篇從MEDLINE和其他生命科學(xué)期刊上檢索到的生物醫(yī)學(xué)文章的文章。
蛋白
此服務(wù)允許您搜索蛋白質(zhì)序列。在Entrez檢索系統(tǒng)的蛋白質(zhì)條目已經(jīng)從各種來源,包括SwissProt,PIR,PRF,PDB編譯,并注明編碼區(qū)序列及參考譯文。
popset
PopSet是一個(gè)組的DNA序列,已收集到分析一個(gè)種群的進(jìn)化關(guān)系。種群可能起源于同一物種的不同成員,或來自不同物種的生物體。他們提交到GenBank的亮片,往往作為一個(gè)序列比對
軟件特色
序列
在序列視圖的右邊是一組選項(xiàng),允許您更改序列的表示方式。從樣本文件/蛋白質(zhì)文件夾中選擇受體激酶序列。這個(gè)序列的長度是543個(gè)殘基,所以不可能在一個(gè)文本屏幕上顯示所有的氨基酸和注釋。因此,該序列呈現(xiàn)“放大”,以顯示序列及其注釋的概述。注釋可以顯示和隱藏使用 注釋選項(xiàng)。
嘗試拖動(dòng)選擇(單擊,然后拖動(dòng))序列的一個(gè)區(qū)域來選擇序列的一部分。也可以嘗試單擊注釋(在序列下面的有色軌道)來選擇注釋所覆蓋的區(qū)域。
Geneious將自動(dòng)檢測格式(在這種情況下,F(xiàn)ASTA)問你是否要存儲(chǔ)的序列在一個(gè)表或讓他們分開。點(diǎn)擊保存序列分開這次。文件中的文檔將出現(xiàn)在新文件夾中并被選中,顯示文檔表面板中的文檔和文檔查看器面板中的數(shù)據(jù)。
核苷酸
此服務(wù)允許您搜索核苷酸序列。Entrez核苷酸數(shù)據(jù)庫從幾個(gè)來源,包括GenBank,RefSeq序列的集合,和PDB。
安裝方法
1、單擊“Geneious_win64_9_1_2_with_jre.exe”安裝圖標(biāo),根據(jù)屏幕提示逐步進(jìn)行安裝。在安裝過程中,會(huì)有以下提示界面:按步驟操作“下一步”就可以了,安裝過程如下圖所示:
2、系統(tǒng)顯示安裝協(xié)議,如圖所示,請仔細(xì)閱讀該協(xié)議。選擇“我同意該許可協(xié)議的條款”后按“下一步”。
3、系統(tǒng)默認(rèn)安裝目錄為C:Program FilesGeneious。用戶按“瀏覽”可以選擇其他安裝目錄。確定安裝目錄后,按“安裝”。
4、確認(rèn)安裝將在開始菜單中創(chuàng)建名為"Geneious"的菜單項(xiàng),本系統(tǒng)運(yùn)行的快捷方式存儲(chǔ)在該菜單中,選擇好后點(diǎn)擊『下一步』:
5、選擇附加任務(wù)允許幫助用戶在固定的位置建立快捷方式,方便使用,在需要建立快捷方式的選項(xiàng)前打勾,然后點(diǎn)擊『下一步』:
6、在安裝過程中,安裝程序?qū)⒁赃M(jìn)度條的方式顯示安裝過程,用戶點(diǎn)擊『取消』按鈕可取消整個(gè)安裝過程:
7、點(diǎn)擊“安裝”按鈕后,系統(tǒng)將創(chuàng)建安裝目錄,并將系統(tǒng)安裝在該目錄中。圖為系統(tǒng)安裝完成界面。
使用方法
通過復(fù)制和粘貼,可以將文檔從外部數(shù)據(jù)庫復(fù)制到本地文件夾。復(fù)制和粘貼可從編輯菜單中獲得。還可以將文檔直接從文檔表拖到所需文件夾。
文件夾:對齊
此文件夾是本地文檔服務(wù)的一部分。這項(xiàng)服務(wù)是用于文件永久本地存儲(chǔ)你: ? 下載從外部數(shù)據(jù)庫,如NCBI或聯(lián)系人的共享文件夾 ? 創(chuàng)建,如調(diào)整或建立一個(gè)樹從現(xiàn)有的文件 ? 進(jìn)口通過文件->導(dǎo)入
順序查看幫助
序列視圖是一種高度可定制的蛋白質(zhì)和核苷酸序列、序列比對、循環(huán)序列和系統(tǒng)發(fā)育樹的查看器。
縮放
序列視圖允許您放大查看單個(gè)殘基或縮小以查看整個(gè)序列及其所有注釋??刂谱兘沟陌粹o位于順序視圖右邊的選項(xiàng)面板的頂部。您也可以按住Alt或Ctrl,并將鼠標(biāo)滾輪向上/向下放大/縮小或ALT點(diǎn)擊放大或Alt Shift點(diǎn)擊縮小。
下載幫助
所選文檔僅為完整文檔的摘要。在進(jìn)行進(jìn)一步分析之前,您應(yīng)該單擊“下載”下載完整文檔。下載完成后,完整文檔將取代摘要。
選擇和編輯
序列查看器中的選擇和編輯非常類似于標(biāo)準(zhǔn)文本編輯和文字處理程序。單擊并拖動(dòng)以選擇區(qū)域。您可以在一個(gè)對齊的上下移動(dòng)來選擇和編輯多個(gè)序列。單擊“允許編輯”按鈕進(jìn)入編輯模式,并允許您通過在鍵盤上鍵入它們來修改殘留物和空白。
現(xiàn)在可以使用“連接到數(shù)據(jù)庫”按鈕,并輸入詳細(xì)信息以開始使用數(shù)據(jù)庫。如果你的數(shù)據(jù)庫尚未建立,Geneious將詢問您是否要建立數(shù)據(jù)庫。為了使其成功,您必須在數(shù)據(jù)庫上創(chuàng)建權(quán)限。
現(xiàn)在已經(jīng)為您自己設(shè)置了數(shù)據(jù)庫。但是,如果您希望其他用戶使用它,您將需要為每個(gè)應(yīng)該訪問數(shù)據(jù)庫的人設(shè)置數(shù)據(jù)庫用戶帳戶。每個(gè)用戶必須在所有表上選擇、更新、插入和刪除權(quán)限。
使用說明
選擇“coxII CD對齊”從你的比對樣本文件文件夾。選擇基地的對齊和放大為該區(qū)域通過點(diǎn)擊按鈕。單擊“允許編輯工具欄”按鈕,然后通過插入或刪除對齊中的猩猩序列中的殘留物進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
您添加的殘留物將是粗體的,如果需要,您可以通過在注釋和Tracks tab中檢查這個(gè)選項(xiàng)來顯示插入注釋。
注意,當(dāng)默認(rèn)情況下插入序列時(shí),序列被推到右邊。如果希望將序列向左推,則在插入序列時(shí)按住Shift鍵。類似地,在默認(rèn)情況下刪除序列時(shí),序列將從右邊移動(dòng)到刪除區(qū)域。在刪除時(shí)向左移動(dòng)序列,按住Shift鍵時(shí)按住Shift鍵。
你也可以使用任何標(biāo)準(zhǔn)的編輯操作,如復(fù)制(Ctrl或命令+ C)、切(Ctrl或command-x),粘貼(Ctrl或command-v)。解開你的變化在任何時(shí)候,按下Ctrl或command-z.所有操作都是在主編輯菜單。
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Geneious 10下載 10.2.2 免費(fèi)版
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